حجت‌الاسلام مرتضی ملکیان توانست در سال ۱۳۶۱ به امامت جمعه پابدانا از توابع زرند کرمان منصوب شود و در سال ۱۳۶۴ امامت جمعه زرند کرمان را به عهده گرفت و در ادامه این تلاش‌های خود در ۲۱ آبان ۱۳۷۴ شمسی، امامت جمعه زرین‌شهر اصفهان را عهده‌دار شد و از سال ۱۳۸۱ تا حدود دو دهه عهده‌دار تریبون نماز جمعه شاهین‌شهر بود و در مهر ماه 98 به عنوان امام جمعه سپاهان شهر منصوب شد.
